Simon Sieber Research group
Peer-Reviewed Publications
Independent researcher (University of Zurich)
​
​31) S. Zhioua, I. Khan, D. Gonzalez, P. Junier,* S. Sieber*
Science of the Total Environment 2025, 993, 179750.
*Co-corresponding author
30) A. Rutz, D. Probst, C. Aguilar, D. Y. Akiyama, F. Alberti, H. E. Augustijn, N. E. Avalon, C. Beemelmanns, H. B. Barbieri, F. Biermann, A. J. Bridge, E. C. Girón, R. Cox, M. Crüsemann, P. M. D’Agostino, M. Feuermann, J. Gerke, K. G. García, J. E. Holme, J.-Y. Hwang, R. Iacovelli, J. C. J. Barbosa, N. Kaur, M. Klapper, A. M. Köhler, A. Korenskaia, N. Kubach, B. T. Lee, C. Loureiro, S. Mantri, S. Narula, D. Meijer, J. C. Navarro-Muñoz, G.-S. Nguyen, S. Paliyal, M. Panghal, L. Rao, S. Sieber, N. Sokolova, S. T. Sowa, J. Szenei, B. R. Terlouw, H. G. Weddeling, J. Yu, N. Ziemert, T. Weber, K. Blin, J. J. J. van der Hooft, M. H. Medema, M. M. Zdouc
Nucleic Acids Research 2025, gkaf969.
​
29) P. Junier,* G. Cailleau, M. Fatton, P. Udriet, I. Hashmi, D. Bregnard, A. Corona-Ramirez, E. di Francesco, T. Kuhn, N. Mangia, S. Zhioua, D. Hunkeler, S. Bindschedler, S. Sieber,* D. Gonzalez*
A cohesive Microcoleus strain cluster causes benthic cyanotoxic blooms in rivers worldwide
Water Research X 2024, 24, 100252.
*Co-corresponding author
28) M. M. Zdouc, K. Blin, N. L. L. Louwen, J. Navarro, C. Loureiro, C. D. Bader, C. B. Bailey, L. Barra, T. J. Booth, K. A. J. Bozhüyük, J. D. D. Cediel-Becerra, Z. Charlop-Powers, M. G. Chevrette, Y. H. Chooi, P. M. D’Agostino, T. de Rond, E. D. Pup, K. R. Duncan, W. Gu, N. Hanif, E. J. N. Helfrich, M. Jenner, Y. Katsuyama, A. Korenskaia, D. Krug, V. Libis, G. A. Lund, S. Mantri, K. D. Morgan, C. Owen, C.-S. Phan, B. Philmus, Z. L. Reitz, S. L. Robinson, K. S. Singh, R. Teufel, Y. Tong, F. Tugizimana, D. Ulanova, J. M. Winter, C. Aguilar, D. Y. Akiyama, S. A. A. Al-Salihi, M. Alanjary, F. Alberti, G. Aleti, S. A. Alharthi, M. Y. A. Rojo, A. A. Arishi, H. E. Augustijn, N. E. Avalon, J. A. Avelar-Rivas, K. K. Axt, H. B. Barbieri, J. C. J. Barbosa, L. G. B. Segato, S. E. Barrett, M. Baunach, C. Beemelmanns, D. Beqaj, T. Berger, J. Bernaldo-Agüero, S. M. Bettenbühl, V. A. Bielinski, F. Biermann, R. M. Borges, R. Borriss, M. Breitenbach, K. M. Bretscher, M. W. Brigham, L. Buedenbender, B. W. Bulcock, C. Cano-Prieto, J. Capela, V. J. Carrion, R. S. Carter, R. Castelo-Branco, G. Castro-Falcón, F. O. Chagas, E. Charria-Girón, A. A. Chaudhri, V. Chaudhry, H. Choi, Y. Choi, R. Choupannejad, J. Chromy, M. S. C. Donahey, J. Collemare, J. A. Connolly, K. E. Creamer, M. Crüsemann, A. A. Cruz, A. Cumsille, J.-F. Dallery, L. C. Damas-Ramos, T. Damiani, M. de Kruijff, B. D. Martín, G. D. Sala, J. Dillen, D. T. Doering, S. R. Dommaraju, S. Durusu, S. Egbert, M. Ellerhorst, B. Faussurier, A. Fetter, M. Feuermann, D. P. Fewer, J. Foldi, A. Frediansyah, E. A. Garza, A. Gavriilidou, A. Gentile, J. Gerke, H. Gerstmans, J. P. Gomez-Escribano, L. A. González-Salazar, N. E. Grayson, C. Greco, J. E. G. Gomez, S. Guerra, S. G. Flores, A. Gurevich, K. Gutiérrez-García, L. Hart, K. Haslinger, B. He, T. Hebra, J. L. Hemmann, H. Hindra, L. Höing, D. C. Holland, J. E. Holme, T. Horch, P. Hrab, J. Hu, T.-H. Huynh, J.-Y. Hwang, R. Iacovelli, D. Iftime, M. Iorio, S. Jayachandran, E. Jeong, J. Jing, J. J. Jung, Y. Kakumu, E. Kalkreuter, K. B. Kang, S. Kang, W. Kim, G. J. Kim, H. Kim, H. U. Kim, M. Klapper, R. A. Koetsier, C. Kollten, Á. T. Kovács, Y. Kriukova, N. Kubach, A. M. Kunjapur, A. K. Kushnareva, A. Kust, J. Lamber, M. Larralde, N. J. Larsen, A. P. Launay, N.-T.-H. Le, S. Lebeer, B. T. Lee, K. Lee, K. L. Lev, S.-M. Li, Y.-X. Li, C. Licona-Cassani, A. Lien, J. Liu, J. A. V. Lopez, N. V. Machushynets, M. I. Macias, T. Mahmud, M. Maleckis, A. M. Martinez-Martinez, Y. Mast, M. F. Maximo, C. M. McBride, R. M. McLellan, K. M. Bhatt, C. Melkonian, A. Merrild, M. Metsä-Ketelä, D. A. Mitchell, A. V. Müller, G.-S. Nguyen, H. T. Nguyen, T. H. J. Niedermeyer, J. H. O’Hare, A. Ossowicki, B. O. Ostash, H. Otani, L. Padva, S. Paliyal, X. Pan, M. Panghal, D. S. Parade, J. Park, J. Parra, M. P. Rubio, H. T. Pham, S. J. Pidot, J. Piel, B. Pourmohsenin, M. Rakhmanov, S. Ramesh, M. H. Rasmussen, A. Rego, R. Reher, A. J. Rice, A. Rigolet, A. Romero-Otero, L. R. Rosas-Becerra, P. Y. Rosiles, A. Rutz, B. Ryu, L.-A. Sahadeo, M. Saldanha, L. Salvi, E. Sánchez-Carvajal, C. Santos-Medellin, N. Sbaraini, S. M. Schoellhorn, C. Schumm, L. Sehnal, N. Selem, A. D. Shah, T. K. Shishido, S. Sieber, V. Silviani, G. Singh, H. Singh, N. Sokolova, E. C. Sonnenschein, M. Sosio, S. T. Sowa, K. Steffen, E. Stegmann, A. B. Streiff, A. Strüder, F. Surup, T. Svenningsen, D. Sweeney, J. Szenei, A. Tagirdzhanov, B. Tan, M. J. Tarnowski, B. R. Terlouw, T. Rey, N. U. Thome, L. R. T. Ortega, T. Tørring, M. Trindade, A. W. Truman, M. Tvilum, D. W. Udwary, C. Ulbricht, L. Vader, G. P. van Wezel, M. Walmsley, R. Warnasinghe, H. G. Weddeling, A. N. M. Weir, K. Williams, S. E. Williams, T. E. Witte, S. M. W. Rocca, K. Yamada, D. Yang, D. Yang, J. Yu, Z. Zhou, N. Ziemert, L. Zimmer, A. Zimmermann, C. Zimmermann, J. J. J. van der Hooft, R. G. Linington, T. Weber, M. H. Medema,
MIBiG 4.0: advancing biosynthetic gene cluster curation through global collaboration
Nucleic Acids Research 2024, 53, D678–D690.
27) K. Chokshi, K. Kavanagh, I. Khan, V. I. Slaveykova, S. Sieber*
Surface displayed MerR increases mercury accumulation by green microalga Chlamydomonas reinhardtii
Environment International 2024, 189, 108813.
*Corresponding author
26) B. Danneels, M. Blignaut, G. Marti, S. Sieber, P. Vandamme, M. Meyer, A. Carlier
Cyclitol metabolism is a central feature of Burkholderia leaf symbionts
Environmental Microbiology 2023, 25, 454–472.
25) R. J. B. Schäfer, K. Wilson, M. Biedermann, B. S. Moore,* S. Sieber,* H. Wennemers*
Chemical - European Journal 2023, 29, e202203277.
*Co-corresponding author
24) M. J. Müller, A. Dorst, C. Paulus, I. Khan, S. Sieber*
Catch-enrich-release approach for amine-containing natural products
Chemical Communications 2022, 58, 12560–12563.
*Corresponding author
23) J. Wambui, M. J. A. Stevens, S. Sieber, N. Cernela, V. Perreten, R. Stephan
Frontiers in Microbiology 2022, 12, 801467.
22) J. V. D. Molino, R. Carpine, K. Gademann, S. Mayfield,* S. Sieber*
Development of a cell surface display system in Chlamydomonas reinhardtii
Algal Research 2022, 61, 102570.
*Co-corresponding author
​
21) M. Kletecka-Pulker, H. Mondal, D. Wang, R. G. Parra, A. Y. Maigoro, S. Lee, T. Garg, E. J. Mulholland, H. P. Devkota, B. Konwar, S. S. Patnaik, R. Lordan, F. A. Nawaz, C. Tsagkaris, R. A. Rayan, A. M. Louka, R. De, P. Badhe, E. Schaden, H. Willschke, M. Maleczek, H. K. Boyina, G. M. Khalid, Md. S. Uddin, Sanusi, J. Khan, J. I. Odimegwu, A. W. K. Yeung, F. Akram, C. S. Sai, S. Bucher, S. K. Paswan, R. K. Singla, B. Shen, S. D. Lonardo, A. Tosevska, J. Simal-Gandara, M. Zec, E. González-Burgos, M. Habijan, M. Battino, F. Giampieri, A. Tikhonov, D. Cianciosi, T. Y. Forbes-Hernandez, J. L. Quiles, B. Mezzetti, S. B. Babiaka, M. E. O. Ahmed, P. Piccard, M. S. Urquiza, J. R. Depew, F. Schultz, D. Sur, S. R. Pai, M.-A. Găman, M. Cenanovic, N. T. Tzvetkov, S. K. Tripathi, K. R. Kharat, A. T. Garcia-Sosa, S. Sieber, A. G. Atanasov
Current Research in Biotechnology 2021, 3, 146–153.
​
PhD, postdoc, and senior researcher contributions
​
20) J. Ren, A. Mathew, M. Rodríguez-García, C. C. Regli, O. Blacque, B. Spingler, S. Sieber,* L. Eberl,* K. Gademann*
Valdiazen Derivatives for Chemoproteomic Studies in Burkholderia cenocepacia H111
ChemBioChem 2025, 26, e202400945.
*Co-corresponding author
​
19) J. Mas-Roselló, H. Tenor, T. Szabo, R. Naef, S. Sieber,* K. Gademann*
ChemBioChem 2024, 25, DOI 10.1002/cbic.202300801.
*Co-corresponding author
18) J. Ren, A. Mathew, M. Rodríguez-García, T. Kohler, O. Blacque, A. Linden, L. Eberl,* S. Sieber,* K. Gademann*
Functional biosynthetic stereodivergence in a gene cluster via a dihydrosydnone N-oxide
Communications Chemistry 2024, 7, 301.
*Co-corresponding author
​
17) T. D. Grayfer, K. Yamani, E. Jung, G. A. Chesnokov, I. Ferrara, C.-C. Hsiao, A. Georgiou, J. Michel, A. Bailly, S. Sieber, L. Eberl, K. Gademann
Allylic Carbocyclic Inhibitors Covalently Bind Glycoside Hydrolases
JACS Au 2023, 3, 1151–1161.
​
16) A. Georgiou, S. Sieber,* C.-C. Hsiao,* T. Grayfer, J. L. G. López, K. Gademann, L. Eberl, A. Bailly
Leaf nodule endosymbiotic Burkholderia confer targeted allelopathy to their Psychotria hosts
Scientific Reports 2021, 11, 22465.
*Contributed equally
​
15) S. Sieber,* A. Mathew,* C. Jenul, T. Kohler, M. Bär, V. J. Carrión, F. M. Cazorla, U. Stalder, Y.-C. Hsieh, L. Bigler, L. Eberl, K. Gademann
Mitigation of Pseudomonas syringae virulence by signal inactivation
Science Advances 2021, 7, eabg2293.
*Contributed equally
Highlighted in 2 news outlets and as Spotlight in Trends in Plant Science
14) S. D. Schnell, L. V. Hoff, A. Panchagnula, M. H. H. Wurzenberger, T. M. Klapötke, S. Sieber, A. Linden, K. Gademann
3-Bromotetrazine: labelling of macromolecules via monosubstituted bifunctional s -tetrazines
Chemical Science 2020, 11, 3042–3047.
13) S. Sieber,* C. Daeppen,* C. Jenul,* V. Mannancherril, L. Eberl, K. Gademann
ChemBioChem 2020, 350.
*Contributed equally
12) P. Stücheli, S. Sieber, D. W. Fuchs, L. Scheller, T. Strittmatter, P. Saxena, K. Gademann, M. Fussenegger
Genetically encoded betaxanthin-based small-molecular fluorescent reporter for mammalian cells
Nucleic Acids Research 2020, 48, gkaa342.
11) I. S. Shchelik, S. Sieber, K. Gademann
Green Algae as a Drug Delivery System for the Controlled Release of Antibiotics
Chemistry – A European Journal 2020, 26, 16644–16648.
10) S. Sieber, S. M. Grendelmeier, L. A. Harris, D. A. Mitchell, K. Gademann
Microviridin 1777: A Toxic Chymotrypsin Inhibitor Discovered by a Metabologenomic Approach
Journal of Natural Products 2020, 83, 438–446.
9) S. Sieber,* C.-C. Hsiao,* D. Emmanouilidou, A. W. Debowski, K. A. Stubbs, K. Gademann
Syntheses and biological investigations of kirkamide and oseltamivir hybrid derivatives
Tetrahedron 2020, 76, 131386.
*Contributed equally
8) C. Jenul, S. Sieber,* C. Daeppen,* A. Mathew, M. Lardi, G. Pessi, D. Hoepfner, M. Neuburger, A. Linden, K. Gademann, L. Eberl
Biosynthesis of fragin is controlled by a novel quorum sensing signal
Nature Communications 2018, 9, 1297.
*Contributed equally
7) C.-C. Hsiao,* S. Sieber,* A. Georgiou,* A. Bailly, D. Emmanouilidou, A. Carlier, L. Eberl, K. Gademann
Chemistry – A European Journal 2018, 25, 1722–1726.
*Contributed equally
6) M. Pinto-Carbo, S. Sieber, S. Dessein, T. Wicker, B. Verstraete, K. Gademann, L. Eberl, A. Carlier
Evidence of horizontal gene transfer between obligate leaf nodule symbionts
The ISME Journal 2016, 10, 2092–2105.
5) S. Sieber, A. Carlier, M. Neuburger, G. Grabenweger, L. Eberl, K. Gademann
Isolation and Total Synthesis of Kirkamide, an Aminocyclitol from an Obligate Leaf Nodule Symbiont
Angewandte Chemie, International Edition 2015, 127, 8079–8081.
4) C. Portmann, S. Sieber, S. Wirthensohn, J. F. Blom, L. D. Silva, E. Baudat, M. Kaiser, R. Brun, K. Gademann,
Balgacyclamides, antiplasmodial heterocyclic peptides from Microcystis aeruguinosa EAWAG 251
Journal of Natural Products 2014, 77, 557–562.
​
Reviews
3) R. Carpine, S. Sieber*
Current Research in Biotechnology 2021, 3, 65–81.
*Corresponding author
2) C. Jenul, S. Sieber, K. Gademann, L. Eberl
Ein neues Signalmolekül in Burkholderia cenocepacia
BIOspektrum 2019, 25, 368–371.
1) K. Gademann, S. Sieber
Chemical interference of biological systems with natural products
Chimia 2011, 65, 835–838.
​